在无尽的拉格朗日中，主力舰队的编队需要综合考虑指挥值分配、舰船定位和战斗序列。一支标准的主力舰队通常由前中后三排组成，前排以高防御舰船为主，中排侧重持续输出，后排则部署高爆发或控制型舰船。根据九级基地400指挥值的上限，奇美拉巡洋舰（8艘160指挥值）和卡利斯托鱼雷型（8艘160指挥值）构成基础框架，剩余80指挥值可灵活补充防空或输出单位。舰船站位由蓝图预设，无法手动调整，需通过舰种搭配实现战术目标。
战斗序列机制要求优先保护关键舰船。敌方会按照前排＞中排＞后排的顺序攻击，因此前排需配置装甲型舰船如ST59或奇美拉重炮型，其能量抗性＞护甲＞减命中＞生命的加点顺序能最大化生存能力。中排推荐红宝石离子炮型或艾奥级对舰型，后排则选择卡利斯托集束鱼雷等对大型舰特化单位。增援系统可突破指挥值限制，但需注意战巡、航母增援会降低舰队曲速航行速度，建议在接战前部署。
高能辐射区仅限巡洋舰、战列巡洋舰、航空母舰和重型工程舰进入，应舍弃驱护编成。若敌方舰载机占比超过30%，需将4艘光锥级（80指挥值）编入舰队，并搭配蜂巢守卫者护航艇。攻城作战则需混编诺玛M470和云海级等攻城特化舰船，其拆建筑效率可达普通舰船的2-3倍。
FG300装甲型建议优先点满护甲和结构值，侦察舰则强化动力系统。输出型舰船如刺水母需按策略技能＞冷却＞暴击＞爆伤＞伤害＞命中的顺序加点，而奶船应专注冷却和锁定效率。ST59的30点法抗暗改使其对能量武器抗性下降，需通过配件系统补偿防御缺口。将主力舰队命名为采矿护卫队或把高速拆家队标注为主力舰队，能有效干扰敌方侦察判断。舰队属性界面可查看综合火力、移动速度和仓储容量等关键数据，建议每完成一次重大改装后重新评估这些参数，确保其符合当前战略需求。
